Mục tiêu chính của nghiên cứu này là phân tích và đánh giá hiện trạng cũng như những thách thức trong công tác quản lý và vận hành hệ thống thủy lợi của tiểu vùng, hướng tới một cái nhìn khách quan về các vấn đề hiện có. Mặc dù đã có sự đầu tư đáng kể, hệ thống tại thời điểm nghiên cứu vẫn chủ yếu vận hành dựa trên kinh nghiệm, thiếu các quy trình vận hành tiêu chuẩn. Điều này đã dẫn đến việc không tối ưu hóa hoàn toàn tiềm năng sản xuất cho người dân địa phương. Để giải quyết vấn đề này, nghiên cứu đã áp dụng phương pháp tiếp cận kép: phân tích SWOT được thực hiện để đánh giá các yếu tố bên trong và bên ngoài, kết hợp với việc sử dụng mô hình thủy động lực MIKE 11 để mô phỏng các kịch bản vận hành thay thế. Kết quả phân tích đã chỉ ra những điểm yếu trong quản lý, đặc biệt là sự thiếu nhất quán trong vận hành. Kết quả mô phỏng MIKE 11 cho thấy Kịch bản KB5 – kiểm soát cụm cống chính (PT3) cùng với cống Bảo Châu – là chiến lược tối ưu. Chiến lược này đạt được hiệu quả giảm mực nước tương đương với các kịch bản kiểm soát rộng hơn nhưng hiệu quả kinh tế và khả thi hơn về mặt vận hành đối với những năm có mực nước trung bình hoặc thấp. Nghiên cứu này cung cấp cơ sở quan trọng để phát triển các quy trình vận hành thích ứng nhằm đảm bảo tính bền vững lâu dài cho sự phát triển nuôi trồng thủy sản trong tiểu vùng.