Hai giống lúa được lựa chọn bao gồm Đốc Phụng (chịu mặn) và Nếp Mỡ (mẫn cảm với mặn). Cây con được xử lý với dung dịch NaCl nồng độ 100 mM trong thời gian 12 giờ tại thời điểm 14 ngày sau khi nảy mầm, sau đó tiến hành thu mẫu và tách chiết RNA tổng số để phân tích biểu hiện gen. 

Kết quả nghiên cứu cho thấy tổng số gen biểu hiện ở giống Đốc Phụng cao hơn đáng kể so với giống Nếp Mỡ, với số lượng lần lượt là 1.596 và 427 gen, phản ánh khả năng đáp ứng mạnh mẽ hơn của giống chịu mặn trước điều kiện bất lợi. Phần lớn các gen biểu hiện ở cả hai giống đều liên quan đến các chức năng sinh học thuộc nhóm phản ứng với kích thích, đặc biệt là stress mặn. Ngoài ra, một số gen thuộc họ OsDREB được xác định có vai trò quan trọng trong cơ chế phản ứng với mặn, cho thấy tiềm năng ứng dụng trong chọn tạo giống lúa chịu mặn. 

Tổng thể, công trình nghiên cứu cung cấp bằng chứng khoa học về sự khác biệt trong cơ chế điều hòa gen giữa các giống lúa dưới tác động của mặn, đồng thời góp phần làm rõ vai trò của các gen liên quan đến stress trong quá trình thích nghi. Kết quả nghiên cứu có ý nghĩa quan trọng trong việc phát triển các giống lúa có khả năng chịu mặn tốt, góp phần đảm bảo năng suất và ổn định sản xuất nông nghiệp trong bối cảnh biến đổi khí hậu và xâm nhập mặn ngày càng gia tăng.